Olá Chris, tudo bem? Eu já fiz uma escala assim em Bogotá, chegando de manhã e partindo à noite.

Como eu estava sozinha, achei mais seguro pegar um guia turístico, no aeroporto mesmo eles me indicaram, mas isso foi em 2012, então seria bom confirmar as informações, talvez no site:
https://eldorado.aero/en/https://eldorado.aero/en/

O guia me levou até o Monserrate onde você sobe de funicular até o topo, a vista é muito bonita.

Passeamos pelo centro histórico, Plaza de Bolívar, Catedral Primada, e o Museu do Botero.

Como o aeroporto é longe e o trânsito de Bogotá é intenso achei melhor ficar só pelo centro mesmo e já voltar, esse roteiro deu tempo tranquilo. 

Espero que vocês aproveitem. Boa viagem! :)